在楼顶的防水层上垒挡水墙需要谨慎考虑，因为这可能会对防水层造成损害，并影响其防水性能。

防水层的主要作用是防止水分渗透到建筑物内部。在防水层上进行任何施工或改动都需要注意以下几点：
1. 防水层的完整性：垒挡水墙可能需要在防水层上钻孔、固定或施加压力，这可能会导致防水层的破裂、穿孔或损坏。即使使用密封材料进行修补，也难以保证完全恢复防水层的完整性。
2. 防水性能：防水层的设计和施工是为了承受特定的水压和环境条件。在防水层上增加挡水墙可能会改变水压分布，增加防水层的负担，从而降低其防水效果。
3. 排水问题：挡水墙的存在可能会影响楼顶的排水系统。如果挡水墙阻止了正常的水流排放，可能会导致积水和水压增加，进一步损害防水层和建筑物结构。

如果您确实需要在楼顶设置挡水措施，以下是一些建议：
1. 咨询专业人士：最好咨询专业的建筑师、工程师或防水专家，他们可以根据具体情况评估可行性，并提供合适的解决方案。
2. 考虑替代方法：除了垒挡水墙，还可以考虑其他替代方法来实现挡水的目的。例如，可以使用防水卷材、防水涂料或其他专门设计的防水系统来增加防水性能。
3. 遵循建筑规范：确保任何施工都符合当地的建筑规范和标准，以确保建筑物的安全和防水性能。

总之，在楼顶的防水层上垒挡水墙是一个复杂的问题，需要谨慎处理。最好在进行任何施工之前，咨询专业人士的意见，并采取适当的措施来保护防水层和建筑物的结构。